现阶段，因为敏感度限制，大部分方式必须在标识与分析时对样品开展适度的程序增加，但是也有很多人尝试绕开这一难题，如MosaicTechnologies企业引入的固相PCR方式，引物设计非特异强，无而且免去了液相处理繁琐；LynxTherapeutics企业引入大规模的并行处理固相法(Massivelyparallelsolid-phasecloning)，可在一个样品中并且对不计其数的DNA精彩片段开展，表面氨基化的目的，且不用独立和处理分离出来每一个。
俄罗斯科学院恩格尔哈得分子生物学研究所和美国阿贡国家实验室（ANL）的科学家们早在文献中提出了用杂交法测定核酸序列(SBH）新技术的想法。当时用的是多聚寡核酸探针。几乎与此同时英国牛津大学生化系的Sourthern等也取得了在载体固定寡核苷酸及杂交法测序的国际。在这些技术储备的基础上，1994年在美国能源部防御研究计划署，俄罗斯科学院和俄罗斯人类基因组计划1000多万美元的资助下研制出了一种生物芯片，并用于检测尽地中海血样的基因突变，筛选了一百多个外已知的突变基因。
在基片上制备微阵列(即高密度地固定生物分子于基片上)的过程是微阵列芯片的关键技术，发展非常迅速，表面氨基化，相继出现了原位合成、预合成后钢针按触式点样、预合成后毛细管接触式点样、预合成后微泵喷涂等微阵列制备方法。这些方法在提高点样质量和点样效率、降低芯片成本等方面各有长有短。国际上一些大公司和研究机构，如BioRobotics公司、Cartesian公司、TeleChemInterna-tional Inc.Standford大学和生物芯片北京国家工程研究中心等，都在进行微阵列芯片的制备方法及制备系统的研发。 BioRobotics公司开发的芯片制备系统和TeleChem International Inc 的微阵列制备工作头为各研究机构所普遍采用。
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