在养殖水体中，重金属主要来自于养殖水源水的工农业污染，池塘底质重金属超标以及在养殖过程中重金属的使用，包括农药的使用，、仪表，造纸等工业活动污水的排放，各类有色金属矿山的废水，如铜，汞、镉、铬、铅、等各种重金属离子毒物，这些物质在水中比较稳定，是污染水体的剧毒物质。目前由于中国大面积的河道水体污染严重，抽取河道水，对水产养殖存在极大的风险。而在水产养殖过程中，养殖户越来越多地使用地下水来解决养殖过程中的水源问题。但是地下水经常铁，锰，钾等重金属超标，加重水产养殖动物肝脏的负担，严重时造成养殖动物的。一旦水体中有重金属离子的存在，就会通过与水体交换的鳃或者通过饵料进入水生动物体内蓄积，对水生动物造成危害。
重金属对水生动物的危害主要有以下几个方面：
1、由于水体重金属含量超标，对水生动物的鳃有和腐蚀作用，鳃大量分泌粘液，影响了鳃与水体的气体交换，妨碍水生动物的呼吸。
2、重金属离子对鳃的腐蚀作用，是导致鱼继发性烂鳃的一个诱因。
3、水生动物体内重金属含量一旦超标，就容易导致体内的酶及部分蛋白发生变性，酶的活性降低，水生动物的各项生理功能受到影响，直接影响到水生动物的生长和生殖系统的发育。
4，由于水生动物肝脏是主要的，养殖水体重金属超标常常导致重金属在肝脏的蓄积，加重水产养殖动物肝脏的负担，严重时造成养殖动物的。