飞凡检测集团针对C型逆转录病毒的数字PCR检测用引物及检测方法与流程
本申请属于病毒检测技术领域,具体涉及一种针对c型逆转录病毒(c-typeretrovirus)的数字pcr(dpcr)检测技术专利申请事宜。
飞凡检测背景技术:
中国仓鼠卵巢(cho)细胞是一种药用重组蛋白和疫苗生产中的常用细胞,其具有如下优良特点:(1)适用于悬浮培养,可以满足大规模工业生产重组蛋白的要求;(2)产生的抗体分子在结构、功能方面和天然抗体分子较接近;(3)所含人类病毒极少;(4)外源基因可以在cho细胞中稳定地整合;(5)cho细胞是成纤维细胞,几乎不分泌内源性蛋白,对目标重组抗体的分离纯化工作十分有利。
cho细胞中没有人类病毒,并且应用较为广泛。但已有研究也已证实,cho细胞可以表达内源性逆转录病样颗粒,在细胞上清中通常可以检测到103~109/ml的逆转录病毒样颗粒,尤其是通过电子显微镜可以清楚观察到cho细胞中含有c型逆转录病毒颗粒。也为了保证在cho细胞中表达生产的抗体药和疫苗等重组蛋白药物的安全性,需要在生产环节和纯化后对相关病毒颗粒量进行准确检测和定量,尤其是cho细胞系中c型逆转录病毒的定量检测。
现有技术中,*常用的分子检测方法是荧光定量pcr(qpcr)法,其可以通过利用taqman探针法特异性检测c型逆转录病毒颗粒的含量。由于每个逆转录病毒颗粒包含两个病毒基因组rna分子,通过检测病毒基因组rna拷贝数,便可以推算出每制剂的病毒含量。但由于荧光定量pcr属于相对定量,在具体**定量病毒拷贝数时需要先用标准品绘制标准曲线,由此导致病毒拷贝数检测结果主要取决于标准品(标准曲线)的准确性。但实际检测定量中,影响定量pcr检测结果的准确性因素还有:扩增效率、pcr干扰因素、标准品的准确性等诸多因素。c型逆转录病毒的定量检测时,一般是取cho细胞培养上清来纯化病毒核酸,而上清中大量的细胞碎片、蛋白、杂质核酸等杂物,也会干扰pcr扩增,进而导致检测结果不准确。正是基于这些问题,急需一种较好的、较为简便的病毒拷贝数准确定量方法,从而为相关病毒含量的准确确定奠定基础。
数字pcr技术作为第三代pcr技术,是一种单分子扩增技术,是一种不依赖标准品的**定量技术。与传统的荧光定量相比,可实现单分子检测,具有检测准确性高、灵敏性高和抗pcr扩增抑制能力的优点。与qpcr相同,数字pcr技术可以利用taqman探针或sybrgreen染料进行荧光信号检测,*后利用终点信号检测法和泊松分布统计计算,实现样品的**定量。
鉴于qpcr在cho细胞的c型逆转录病毒检测中仍然存在明显改进空间,如何利用数字pcr技术来实现和改进cho细胞中c型逆转录病毒检测工作,对于确保相关产品质量的稳定性具有十分重要的技术意义。
飞凡检测技术实现要素:
针对现有cho细胞中的c型逆转录病毒,本申请目的提供一组针对c型逆转录病毒的数字pcr检测用引物,从而为相关病毒颗粒的准确检测和定量奠定一定技术基础。