履约保证金是招标活动中，中标人为确保履行合同向招标人提供的金钱保证，具有履约担保的性质。履约保函和履约保证金都是履约担保措施，其目的是为了保障合同的履行，降低履约风险。但两者存在一些不同之处：
履约保函的程序比较复杂，但其一旦开出，只要在有效期内完成了合同的规定，那么到了合同约定的期限后，可以直接从银行取走资金，而不需要经过另一方的同意。而履约保证金的手续相对简单，但到了合同期限需要从银行取走保证金的钱款时，必须要经过另一方的同意。
履约保函由保险公司或银行等机构出具，而履约保证金则是由中标人直接提供金钱作为担保。
综上，履约保证金和履约保函在程序、取款条件以及担保措施的提供者等方面存在差异。