物理性质检测则涉及有机肥料的粒度、密度、湿度和机械强度等，这些物理特性会影响肥料的施用效果和储存稳定性。感官评估则是通过观察、闻味等方法来评价肥料的颜色、气味和整体外观，以确保肥料没有明显的变质或污染。
有机肥料的安全性检测也是不可忽视的部分，主要包括重金属含量检测、有害微生物检测以及残留农药和其他有毒有害物质的检测。重金属如汞、铅、镉等的检测对于防止环境污染和作物中毒具有重要意义。有害微生物检测则关注肥料中是否含有病原菌或其他有害生物，以防止疾病的传播。
留农药和其他有毒有害物质的检测则是为了确保有机肥料不会因添加不当而导致农产品安全问题。
有机肥料的功能性检测项目也越来越受到重视，包括有机酸含量测定、酶活性分析和微生物群落结构检测。有机酸含量测定有助于了解有机肥料中有机酸的种类和浓度，这些有机酸能够影响土壤的pH值和作物的吸收能力。酶活性分析则是评估肥料中生物活性的一个重要指标，它能够反映有机肥料对土壤生化过程的促进作用。微生物群落结构检测则可以揭示肥料中的微生物多样性和功能，这对于提高土壤生态平衡和促进作物健康生长具有积极作用。
有机肥料的稳定性和成熟度也是评价其质量的重要指标。稳定性检测主要是通过分析肥料中的碳氮比和腐殖化程度来评估其长期储存和使用过程中的稳定性。成熟度检测则是通过测定肥料中的氨态氮和亚硝酸盐等指标来评价有机肥料的发酵程度，未充分发酵的有机肥料可能会对作物和土壤造成不良影响。